药物所十分注重科学传播，出版了一系列专著，推动了科技创新。建所至2020年底，出版专著372部，其中主编142部（含副主编），主译16部。主编的不少专著还获得各等级奖励，如《核磁共振》、《中药志》、《全国中草药汇编》、《抗菌素生物理化特性》、《同位素技术及其在生物医学中的应用》获得1978年全国科学大会奖。《中草药现代研究（第一、二、三卷）》获1998年卫生部科学技术进步一等奖；《肿瘤化学预防及药物治疗》获1996年卫生部科学技术进步二等奖；《纸色谱和薄层色谱》获1996年卫生部科学技术进步三等奖；《药物化学总论》获1996年卫生部科学技术进步三等奖，及1996年国家医药管理局优秀教材二等奖；《抗癌药物研究与实验技术》获1999年卫生部科学技术进步三等奖；《当代药理学》获1997年北京市科学技术进步三等奖。
主编： 周同惠
副主编：
出版社：西北大学出版社
出版年份：1994
主编： 冯剑波（译）
副主编：程伟 (校译)
出版社：专利文献出版社
出版年份：1995
主编： 赵知中
副主编：
出版社：科学出版社
出版年份：1995
主编： 宋振玉
副主编：周同惠，方起程，巢心明
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1995
主编： 鲁桂琛，James P.Tam， 杜玉刚
副主编：
出版社：ESCOM Science Publishers B. V.
出版年份：1995
主编： 徐叔云
副主编：张均田
出版社：华夏出版社
出版年份：1996
主编： 薛燕，雷跻九
副主编：
出版社：中国环境科学出版社
出版年份：1996
主编： 宋振玉
副主编：周同惠，方起程，巢心明
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1996
主编： 冯剑波（译)
副主编：张均田（校）
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1997
主编： 杜慧群，刘齐
副主编：郑新，田力，高幼帛
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1997
主编： 宋振玉
副主编：周同惠，方起程，巢心明
出版社：北京医科大学 中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1997
主编： 韩锐
副主编：
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1997
主编： 张均田
副主编：
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1998
主编： 张均田
副主编：
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1998
主编： 周同惠
副主编：常文保，莫述诚
出版社：科学出版社
出版年份：1998
主编： 宋振玉
副主编：周同惠，方起程，巢心明
出版社：北京医科大学中国协和医科大学联合出版社
出版年份：1999
主编： 郝和平
副主编：卜长生，刘秦玉，薛淼，顾汉卿，奚廷斐，王爱平
出版社：中国标准出版社
出版年份：2000
主编： 吴镭
副主编：丁健，王晓良，李伯良，郝小江，黄文龙，蒋建东
出版社：中国医药科技出版社
出版年份：2000
主编： 刘国芬
副主编：李芸，赵维夷
出版社：金盾出版社
出版年份：2000
主编： 沙世炎，田洪洲
副主编：
出版社：中国医药科技出版社
出版年份：2000
主编： 何丽一
副主编：
出版社：化学工业出版社
出版年份：2000
