2024年11月22日至24日，由工业和信息化部人才交流中心主办的全国仿真创新应用大赛全国总决赛在西北工业大学成功举办。由药物所新药开发室吴松研究员团队的研究生滕睿、张高、刘清心、王磊、杨博超参与，夏杰副研究员、吴松研究员共同指导的《小分子抗菌药物AI自动设计软件AutoMoIDesigner^©》项目经省级赛区评选成功入围全国总决赛，并在决赛中脱颖而出，位列医学仿真应用赛道药学方向第1名，斩获全国一等奖。

全国仿真创新应用大赛是我国仿真技术创新应用领域最高水平的技术竞赛，聚焦新时代仿真技术应用领域的发展与创新。本次大赛以“创新引领，铸就未来”为主题，采用初赛、省级赛区决赛、全国总决赛三级赛制，吸引了全国众多企业、高校、医疗机构、军事机构等单位参加，是一项高水平的全国性赛事。

近年来，吴松研究员团队聚焦于人工智能药物设计新技术的研究及新药研发实践，取得了一系列阶段性成果。作为代表性工作之一的AutoMoIDesigner^©，是基于生成式化学语言模型、自动机器学习等先进的人工智能技术开发的一款可在个人电脑运行、无需编程的自动药物分子设计软件。药物所具有独立的知识产权（计算机软件著作权：2023SR1040550，2024SR1242953）。该软件实现了生物活性、可合成性和成药性等药物分子多目标协同优化，同时解决了非计算机专业科研人员对人工智能药物设计软件的可及性，目前国际上很少有此类单机版软件。该软件曾以封面论文发表于计算化学权威期刊（J. Chem. Inf. Model. 2024, 64, 3, 575–583），在国际数据资源下载平台Zenodo下载次数已近900次。并且，项目团队将AutoMolDesigner^©应用于多个小分子抗菌药物研发实践，发现了包括ZXT-4-23在内的多个高质量的抗菌药物先导结构或候选物，并实现了对外技术服务，有望助力基于人工智能药物发现体系构建和实践。

本获奖项目得到了中国医学科学院医学与健康科技创新工程重大协同创新项目（2021-I2M-1-069）的资助。