主要从事药物代谢、药代动力学及肠道菌药物药理学研究，聚焦在天然药物与肠道菌相互作用及分子机制领域，重点围绕以下几个方面开展：
1）肠道菌与天然药物相互作用关键技术研究及运用；
2）基于肠道菌的天然药物及天然活性成分代谢转化及药代动力学；
3）肠道菌与临床慢病机制研究及个性化治疗；
4）用于结直肠癌早期诊断的多肽探针体内代谢及关键技术研发。基于上述研究，已形成了一个独特的基于肠道菌的药物代谢及药理学研究方向，为全面认知药物“如何奏效”开辟了新途径，尤其是对解释天然药物标本兼治、扶正祛邪赋予了实际的科学内涵，同时对中药异病同治等给出了科学答案。该研究为探索并发现以肠菌为靶点的慢病治疗创新药物提供了强有力的技术支撑，为药物临床转化及个性化治疗提供了有价值的科学证据。